Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC1A2P43004 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms