Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2E2P29084 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms