Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DNMT1P26358 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms