Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ESRRAP11474 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms