Protein–RNA interactions for Protein: P0DP91

CSB-PGBD3, Chimeric ERCC6-PGBD3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSB-PGBD3P0DP91 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSB-PGBD3P0DP91 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSB-PGBD3P0DP91 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms