Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2P0DI81 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms