Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRCP08575 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms