Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEFLP07196 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEFLP07196 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEFLP07196 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms