Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOL3O95236 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOL3O95236 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOL3O95236 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOL3O95236 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOL3O95236 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
APOL3O95236 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOL3O95236 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOL3O95236 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOL3O95236 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOL3O95236 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
APOL3O95236 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOL3O95236 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOL3O95236 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms