Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ZNF879B4DU55 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF879B4DU55 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms