Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN3Q9P232 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms