Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TREX1Q9NSU2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms