Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPAG4Q9NPE6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms