Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP31

SH2D2A, SH2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D2AQ9NP31 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SH2D2AQ9NP31 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SH2D2AQ9NP31 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D2AQ9NP31 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms