Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CRACR2AQ9BSW2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms