Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM54Q969K7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms