Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CCBE1Q6UXH8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCBE1Q6UXH8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms