Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HSD17B12Q53GQ0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HSD17B12Q53GQ0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms