Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms