Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDO1Q16878 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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