Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK4Q16654 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK4Q16654 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms