Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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TRIP13Q15645 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIP13Q15645 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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