Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNMA1Q12791 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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