Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IFITM3Q01628 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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