Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYBPC1Q00872 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms