Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VLDLRP98155 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms