Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA1P56159 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms