Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms