Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACADSBP45954 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms