Protein–RNA interactions for Protein: P34903

GABRA3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA3P34903 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA3P34903 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA3P34903 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA3P34903 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA3P34903 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA3P34903 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABRA3P34903 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms