Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NTF4P34130 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NTF4P34130 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NTF4P34130 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NTF4P34130 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NTF4P34130 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NTF4P34130 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms