Protein–RNA interactions for Protein: P32320

CDA, Cytidine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDAP32320 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDAP32320 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDAP32320 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDAP32320 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDAP32320 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDAP32320 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDAP32320 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDAP32320 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDAP32320 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms