Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CASP1P29466 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CASP1P29466 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CASP1P29466 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms