Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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PDE6GP18545 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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