Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DESP17661 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DESP17661 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DESP17661 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DESP17661 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DESP17661 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DESP17661 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DESP17661 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DESP17661 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DESP17661 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DESP17661 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DESP17661 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DESP17661 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms