Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC159P0C7I6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC159P0C7I6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms