Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHG1P01857 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHG1P01857 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms