Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABARAPO95166 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABARAPO95166 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms