Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMC8O43402 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMC8O43402 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMC8O43402 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMC8O43402 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EMC8O43402 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EMC8O43402 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EMC8O43402 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms