Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GOLGA8SH3BPF8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms