Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARID3CA6NKF2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARID3CA6NKF2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms