Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms