Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
V9GYV3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
V9GYV3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
V9GYV3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
V9GYV3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
V9GYV3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
V9GYV3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
V9GYV3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
V9GYV3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
V9GYV3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
V9GYV3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms