Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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KCNIP3Q9Y2W7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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KCNIP3Q9Y2W7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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KCNIP3Q9Y2W7 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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KCNIP3Q9Y2W7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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KCNIP3Q9Y2W7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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KCNIP3Q9Y2W7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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KCNIP3Q9Y2W7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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KCNIP3Q9Y2W7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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KCNIP3Q9Y2W7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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KCNIP3Q9Y2W7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KCNIP3Q9Y2W7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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