Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COPG2Q9UBF2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms