Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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