Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PARVAQ9NVD7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PARVAQ9NVD7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms