Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms