Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM8Q9BZR9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM8Q9BZR9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms