Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRIP1Q9BX63 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BRIP1Q9BX63 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms